Contig Alignment

Base A B C D E F G H I J K L M N O P
1 A A . A A . . . . . . . . . . .
2 G G . G G . . . . . . . . . . .
3 G G . G G G . . . . . . . . . .
4 C C . C C C . C . . . . . . . .
5 A A . A A A . A . . . . . . . .
6 G G . G G G . G . . . . . . . .
7 A A . A A A . A . . . . . . . .
8 A A . A A A . A . . . . . . . .
9 G G . G G G . G . . . . . . . .
10 T T . T T T . T . . . . . . . .
11 T T . T T T . T . . . . . . . .
12 T T . T T T . T . . . . . . . .
13 A A . A A A . A . . . . . . . .
14 T T . T T T . T . . . . . . . .
15 T T . T T T . T . . . . . . . .
16 T T . T T T . T . . . . . . . .
17 T T . T T T . T . . . . . . . .
18 A A . A A A . A . . . . . . . .
19 A A . A A A . A . . . . . . . .
20 T T . T T T . T . . . . . . . .
21 T T . T T T . T . . . . . . . .
22 T T . T T T . T . . . . . . . .
23 A A . A A A . A . . . . . . . .
24 T T . T T T . T . . . . . . . .
25 T T . T T T . T . . . . . . . .
26 A A . A A A . A . . . . . . . .
27 T T . T T T . T . . . . . . . .
28 A A . A A A . A . . . . . . . .
29 C C . C C C . C . . . . . . . .
30 G G . G C G . G . . . . . . . .
31 C C . C C C . C . . . . . . . .
32 C C . C T C . C . . . . . . . .
33 T T . T T T . T . . . . . . . .
34 C C . C C C . C . . . . . . . .
35 G G . G G G . G . . . . . . . .
36 C C . C C C . C . . . . . . . .
37 A A . A A A . A . . . . . . . .
38 C C . C C C . C . . . . . . . .
39 A A . A A A . A . . . . . . . .
40 C C . C C C . C . . . . . . . .
41 G G . G G G . G . . . . . . . .
42 G G . C C G . G . . . . . . . .
43 C C . C C C . C . . . . . . . .
44 A A . A A A . A . . . . . . . .
45 T T . T T T . T . . . . . . . .
46 C C . C C C . C . . . . . . . .
47 A A . A A A . A . . . . . . . .
48 A A . A A A . A . . . . . . . .
49 C C . C C C . C . . . . . . . .
50 A A . A A A . A . . . . . . . .
51 T T . T T T . T . . . . . . . .
52 A A . A A A . A . . . . . . . .
53 A A . A A A . A . . . . . . . .
54 A A . A A A . A . . . . . . . .
55 C C . C C C . C . . . . . . . .
56 A A . A A A . A . . . . . . . .
57 A A . A A A . A . . . . . . . .
58 G G . G G G . G . . . . . . . .
59 C C . C C C . C . . . . . . . .
60 A A . A A A . A . . . . . . . .
61 C C . C C C . C . . . . . . . .
62 A A . A A A . A . . . . . . . .
63 A A . A A A . A . . . . . . . .
64 A A . A A A . A . . . . . . . .
65 C C . C C C . C . . . . . . . .
66 A A . A A A . A . . . . . . . .
67 C C . C C C . C . . . . . . . .
68 A A . A A A . A . . . . . . . .
69 G G . G G G . G . . . . . . . .
70 C C . C C C . C . . . . . . . .
71 C C . C C C . C . . . . . . . .
72 A A . A A A . A . . . . . . . .
73 C C . C C C . C . . . . . . . .
74 T T . T T T . T . . . . . . . .
75 A A . A A A . A . . . . . . . .
76 A A . A A A . A . . . . . . . .
77 A A . A A A . A . . . . . . . .
78 A A . A A A . A . . . . . . . .
79 C C . C C C . C . . . . . . . .
80 T T . T T T . T . . . . . . . .
81 T T . T T T . T . . . . . . . .
82 T T . T T T . T . . . . . . . .
83 T T . T T T . T . . . . . . . .
84 A A . A A A . A . . . . . . . .
85 A A . A A A . A . . . . . . . .
86 T T . T T T . T . . . . . . . .
87 G G G G G G G G . . . . . . . .
88 A A A A A A A A . . . . . . . .
89 T T T T T T T T . . . . . . . .
90 A A A A A A A A . . . . . . . .
91 A A A A A A A A . . . . . . . .
92 T T T T T T T T . . . . . . . .
93 T T T T T T T T . . . . . . . .
94 T T T T T T T T . . . . . . . .
95 T T T T T T T T . . . . . . . .
96 A A A A A A A A . . . . . . . .
97 A G G G G G G G . . . . . . . .
98 A A A A A A A A . . . . . . . .
99 C C C C C C C C . . . . . . . .
100 G G G G G G G G . . . . . . . .
101 A A A A A A A A . . . . . . . .
102 C C C C C C C C . . . . . . . .
103 G G G G G G G G . . . . . . . .
104 T T T T T T T T . . . . . . . .
105 C C C C C C C C . . . . . . . .
106 A A A A A A A A . . . . . . . .
107 G G G G G G G G . . . . . . . .
108 C C C C C C C C . . . . . . . .
109 C C C C C C C C . . . . . . . .
110 G G G G G G G G . . . . . . . .
111 A A C C C A A A . . . . . . . .
112 G G G G G G G G . . . . . . . .
113 G G G G G G G G . . . . . . . .
114 G G G G G G G G . . . . . . . .
115 C C C C C C C C . . . . . . . .
116 A A A A A A A A . . . . . . . .
117 A A A A A A A A . . . . . . . .
118 G G G G G G G G . . . . . . . .
119 C C C C C C C C . . . . . . . .
120 T T T T T T T T . . . . . . . .
121 G G G G G G G G . . . . . . . .
122 A A A A A A A A . . . . . . . .
123 C C C C C C C C . . . . . . . .
124 G G G G G G G G . . . . . . . .
125 T T T T T T T T . . . . . . . .
126 A A A A A A A A . . . . . . . .
127 G G G G G G G G . . . . . . . .
128 C C C C C C C C . . . . . . . .
129 C C C C C C C C . . . . . . . .
130 G G G G G G G G . . . . . . . .
131 A A A A A A A A . . . . . . . .
132 G G G G G G G G . . . . . . . .
133 C C C C C C C C . . . . . . . .
134 T T T T T T T T . . . . . . . .
135 T T T T T T T T . . . . . . . .
136 C C C C C C C C . . . . . . . .
137 C C C C C C C C . . . . . . . .
138 T T T T T T T T . . . . . . . .
139 T T T T T T T T . . . . . . . .
140 G G G G G G G G . . . . . . . .
141 G G G G G G G G . . . . . . . .
142 C C C C C C C C . . . . . . . .
143 A A A A A A A A . . . . . . . .
144 C C C C C C C C . . . . . . . .
145 A A A A A A A A . . . . . . . .
146 G G G G G G G G . . . . . . . .
147 C C C C C C C C . . . . . . . .
148 G G G G G G G G . . . . . . . .
149 T T T T T T T T . . . . . . . .
150 C C C C C C C C . . . . . . . .
151 C C C C C C C C . . . . . . . .
152 T T T T T T T T . . . . . . . .
153 C C C C C C C C . . . . . . . .
154 T T T T T T T T . . . . . . . .
155 T T T T T T T T . . . . . . . .
156 C C C C C C C C . . . . . . . .
157 T T T T T T T T . . . . . . . .
158 T T T T T T T T . . . . . . . .
159 C C C C C C C C . . . . . . . .
160 G G G G G G G G . . . . . . . .
161 G T T T T T T T . . . . . . . .
162 G G G G G G G G . . . . . . . .
163 C C C C C C C C . . . . . . . .
164 C C C C C C C C . . . . . . . .
165 G G G G G G G G . . . . . . . .
166 C C C C C C C C . . . . . . . .
167 T T T T T T T T . . . . . . . .
168 T T T T T T T T . . . . . . . .
169 C C C C C C C C . . . . . . . .
170 T T T T T T T T . . . . . . . .
171 T T T T T T T T . . . . . . . .
172 G G G G G G G G . . . . . . . .
173 C C C C C C C C . . . . . . . .
174 A A A A A A A A . . . . . . . .
175 C C C C C C C C . . . . . . . .
176 C C C C C C C C . . . . . . . .
177 C C C C C C C C . . . . . . . .
178 C C C C C C C C . . . . . . . .
179 G G G G G G G G . . . . . . . .
180 A A A A A A A A . . . . . . . .
181 A A A A A A A A . . . . . . . .
182 T T T T T T T T . . . . . . . .
183 G G G G G G G G . . . . . . . .
184 C C C C C C C C . . . . . . . .
185 A A A A A A A A . . . . . . . .
186 A A A A A A A A . . . . . . . .
187 C C C C C C C C . . . . . . . .
188 A A A A A A A A . . . . . . . .
189 C C C C C C C C . . . . . . . .
190 C C C C C C C C . . . . . . . .
191 A A A A A A A A . . . . . . . .
192 C C C C C C C C . . . . . . . .
193 G G G G G G G G . . . . . . . .
194 A A A A A A A A . . . . . . . .
195 A A A A A A A A . . . . . . . .
196 C C C C C C C C . . . . . . . .
197 G G G G G G G G . . . . . . . .
198 C C C C C C C C . . . . . . . .
199 C C C C C C C C . . . . . . . .
200 C C C C C C C C . . . . . . . .
201 C C C G C C C C . . . . . . . .
202 C C C C C C C C . . . . . . . .
203 A A A A A A A A . . . . . . . .
204 A A A A A A A A . . . . . . . .
205 C C C C C C C C . . . . . . . .
206 T T T T T T T T . . . . . . . .
207 C C C C C C C C . . . . . . . .
208 C C C C C C C C . . . . . . . .
209 A A A A A A A A . . . . . . . .
210 C C C C C C C C . . . . . . . .
211 G G G G G G G G . . . . . . . .
212 A A A A A A A A A . . . . . . .
213 A A A A A A A A A . . . . . . .
214 A A A A A A A A A . . . . . . .
215 C C C C C C C C C . . . . . . .
216 T T T T T T T T T . . . . . . .
217 A A A A A A A A A . . . . . . .
218 A A A A A A A A A . . . . . . .
219 C C C C C C C C C . . . . . . .
220 C C C C C C C C C . . . . . . .
221 A A A A A A A A A . . . . . . .
222 C C C C C C C C C . . . . . . .
223 C C A A A C C C C . . . . . . .
224 T T T T T T T T T . . . . . . .
225 T T T T T T T T T . . . . . . .
226 C C C C C C C C C . . . . . . .
227 G G G G G G G G G . . . . . . .
228 T T T T T T T T T . . . . . . .
229 C C C C C C C C C . . . . . . .
230 A A A A A A A A A . . . . . . .
231 C C C C C C C C C . . . . . . .
232 C C C C C C C C C . . . . . . .
233 G G G G G G G G G . . . . . . .
234 C C C C C C C C C . . . . . . .
235 A A A A A A A A A . . . . . . .
236 A A A A A A A A A . . . . . . .
237 C C C C C C C C C . . . . . . .
238 A A A A A A A A A . . . . . . .
239 G G G G G G G G G . . . . . . .
240 A A A A A A A A A . . . . . . .
241 A A A A A A A A A . . . . . . .
242 C C C C C C C C C . . . . . . .
243 C C C C C C C C C . . . . . . .
244 C C C C C C C C C . . . . . . .
245 A A A A A A A A A . . . . . . .
246 A A A A A A A A A . . . . . . .
247 T T T T T T T T T . . . . . . .
248 C C C C C C C C C . . . . . . .
249 C C C C C C C C C . . . . . . .
250 C C C C C C C C C . . . . . . .
251 A A A A A A A A A . . . . . . .
252 C C C C C C C C C . . . . . . .
253 G G G G G G G G G . . . . . . .
254 C C C C C C C C C . . . . . . .
255 A A A A A A A A A . . . . . . .
256 A G G G G G G G G . . . . . . .
257 A A A A A A A A A . . . . . . .
258 G G G G G G G G G . . . . . . .
259 T T T T T T T T T . . . . . . .
260 T T T T T T T T T . . . . . . .
261 G G G G G G G G G . . . . . . .
262 C C C C C C C C C . . . . . . .
263 C C C C C C C C C . . . . . . .
264 C C C C C C C C C . . . . . . .
265 C C C C C C C C C . . . . . . .
266 C C C C C C C C C . . . . . . .
267 A A A A A A A A A . . . . . . .
268 C C C C C C C C C . . . . . . .
269 A A A A A A A A A . . . . . . .
270 G G G G G G G G G . . . . . . .
271 A A A A A A A A A . . . . . . .
272 C C C C C C C C C . . . . . . .
273 C C C C C C C C C . . . . . . .
274 C C C C C C C C C . . . . . . .
275 A A A A A A A A A . . . . . . .
276 G G G G G G G G G . . . . . . .
277 A A A A A A A A A . . . . . . .
278 T T T T T T T T T . . . . . . .
279 G G G G G G G G G . . . . . . .
280 C C C C C C C C C . . . . . . .
281 A A A A A A A A A . . . . . . .
282 A A A A A A A A C . . . . . . .
283 C C C C C C C C C . . . . . . .
284 C C C C C C C C T . . . . . . .
285 T T T T T T T T T . . . . . . .
286 C C C C C C C C C . . . . . . .
287 C C C C C C C C C . . . . . . .
288 T T T T T T T T T . . . . . . .
289 G G G G G G G G G . . . . . . .
290 G G G G G G G G G . . . . . . .
291 G T T T T T T T T . . . . . . .
292 G G G G G G G G G . . . . . . .
293 G G G G G G G G G . . . . . . .
294 C C C C C C C C C . . . . . . .
295 T T T T T T T T T . . . . . . .
296 G G G G G G G G G . . . . . . .
297 C C C C C C C C C . . . . . . .
298 T T T T T T T T T . . . . . . .
299 G G G G G G G G G . . . . . . .
300 T T T T T T T T T . . . . . . .
301 C C C C C C C C C . . . . . . .
302 T T T T T T T T T . . . . . . .
303 G G G G G G G G G . . . . . . .
304 A A A A A A A A A . . . . . . .
305 G G G G G G G G G . . . . . . .
306 C C C C C C C C C . . . . . . .
307 C C C C C C C C C . . . . . . .
308 A A A A A A A A A . . . . . . .
309 C C C C C C C C C . . . . . . .
310 G G G G G G G G G . . . . . . .
311 T T C C C T T T T . . . . . . .
312 C C C C C C C C C . . . . . . .
313 C C C C C C C C C . . . . . . .
314 A A A A A A A A A . . . . . . .
315 A A A A A A A A A . . . . . . .
316 G G G G G G G G G . . . . . . .
317 G G G G G G G G G . . . . . . .
318 C C C C C C C C C . . . . . . .
319 A A A A A A A A A . . . . . . .
320 T T T T T T T T T . . . . . . .
321 A A A A A A A A A . . . . . . .
322 T T T T T T T T T . . . . . . .
323 C C C C C C C C C . . . . . . .
324 C C C C C C C C C . . . . . . .
325 A A A A A A A A A . . . . . . .
326 A A A A A A A A A . . . . . . .
327 C C C C C C C C C . . . . . . .
328 T T T T T T T T T . . . . . . .
329 A A A A A A A A A . . . . . . .
330 C C C C C C C C C . . . . . . .
331 G G G G G G G G G . . . . . . .
332 A A A A A A A A A . . . . . . .
333 A A A A A A A A A . . . . . . .
334 C C C C C C C C C . . . . . . .
335 A A A A A A A A A . . . . . . .
336 A A A A A A A A A . . . . . . .
337 C C C C C C C C C . . . . . . .
338 A A A A A A A A A . . . . . . .
339 C C C C C C C C C . . . . . . .
340 C C C C C C C C C . . . . . . .
341 A A A A A A A A A . . . . . . .
342 C C C C C C C C C . . . . . . .
343 C C C C C C C C C . . . . . . .
344 A A A A A A A A A . . . . . . .
345 C C C C C C C C C . . . . . . .
346 G G G G G G G G G . . . . . . .
347 A A A A A A A A A . . . . . . .
348 T T T T T T T T T . . . . . . .
349 G G G G G G G G G . . . . . . .
350 C C C C C C C C C . . . . . . .
351 C C C C C C C C C . . . . . . .
352 T T T T T T T T T . . . . . . .
353 A A A A A A A A A . . . . . . .
354 C C C C C C C C C . . . . . . .
355 G G G G G G G G G . . . . . . .
356 C C C C C C C C C . . . . . . .
357 C C C C C C C C C . . . . . . .
358 T T T T T T T C T . . . . . . .
359 C C C C C C C C C . . . . . . .
360 G G G G G G G G G . . . . . . .
361 C C C C C C C C C . . . . . . .
362 C C C C C C C C C . . . . . . .
363 A A A A A A A A A . . . . . . .
364 C C C C C C C C C . . . . . . .
365 T T T T T T T T T . . . . . . .
366 T T T T T T T T T . . . . . . .
367 G G G G G G G G G . . . . . . .
368 C C C C C C C C C . . . . . . .
369 T T T T T T T T T . . . . . . .
370 C C C C C C C C C . . . . . . .
371 C C C C C C C C C . . . . . . .
372 C C C C C C C C C . . . . . . .
373 C C C C C C C C C . . . . . . .
374 C C C C C C C C C . . . . . . .
375 G G G G G G G G G . . . . . . .
376 G G G G G G G G G . . . . . . .
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380 A A A A A A A A A . . . . . . .
381 G G G G G G G G G . . . . . . .
382 C C C C C C C C C . . . . . . .
383 T T T T T T T T T . . . . . . .
384 C C C C C C C C C . . . . . . .
385 C C C C C C C C C . . . . . . .
386 T T T T T T T T T . . . . . . .
387 T T T T T T T T T . . . . . . .
388 C C C C C C C C C . . . . . . .
389 G G G G G G G G G . . . . . . .
390 C C C C C C C C C . . . . . . .
391 C C C C C C C C C . . . . . . .
392 C C C C C C C C C . . . . . . .
393 T T T T T T T T T . . . . . . .
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400 G G G G G G G G G G . . . . . .
401 G G G G G G G G G G . . . . . .
402 C C C C C C C C C C . . . . . .
403 C C C C C C C C C C . . . . . .
404 T T T T T T T T T T . . . . . .
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410 C C C C C C C C C C C . . . . .
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438 C C C C C C C C C C C C . . . .
439 C C C C C C C C C C C C . . . .
440 A A A A A A A A A A A A . . . .
441 C C C C C C C C C C C C . . . .
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444 C C C C C C C C C C C C . . . .
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452 G G G G G G G G G G G G . . . .
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457 A A A A A A A A A A A A . . . .
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460 C C C C C C C C C C C C . . . .
461 A A A A A A A A A A A A . . . .
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463 C C C C C C C C C C C C . . . .
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466 C C C C C C C C C C C C . . . .
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468 G G G G G G G G G G G G . . . .
469 G G G G G G G G G G G G . . . .
470 T T T T T T T T T T T T . . . .
471 A A A A A A A A A A A A . . . .
472 C C C C C C C C C C C C . . . .
473 A A A A A A A A A A A A . . . .
474 C C C C C C C C C C C C . . . .
475 C C C C C C C C C C C C . . . .
476 C C C C C C C C C C C C . . . .
477 A A A A A A A A A A A A . . . .
478 C C C C C C C C C C C C . . . .
479 C C C C C C C C C C C C . . . .
480 A A A A A A A A A A A A . . . .
481 G G G G G G G G G G G G . . . .
482 G G G G G G G G G C G G . . . .
483 C C C C C C C C C C C C . . . .
484 C C C C C C C C C C C C . . . .
485 G G G G G G G G G G G G . . . .
486 C C C C C C C C C C C C . . . .
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488 T T G G G T T T T T G T . . . .
489 C C C C C C C C C C C C . . . .
490 C C C C C C C C C C C C . . . .
491 G G G G G G G G G G G G . . . .
492 C C C C C C C C C C C C . . . .
493 G G G G G G G G G G G G . . . .
494 A A A A A A A A A A A A . . . .
495 C C C C C C C C C C C C . . . .
496 A A A A A A A A A A A A . . . .
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498 C C C C C C C C C C C C . . . .
499 C C C C C C C C C C C C . . . .
500 A A A A A A A A A A A A . . . .
501 G G G G G G G G G G G G . . . .
502 G G G G G G G G G G G G . . . .
503 G G G G G G G G G G G G . . . .
504 C C C C C C C C C C C C . . . .
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506 G G G G G G G G G G G G . . . .
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509 G G G G G G G G G G G G . . . .
510 C C C C C C C C C C C C . . . .
511 C C C C C C C C C C C C . . . .
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513 A A A A A A A A A A A A . . . .
514 C C C C C C C C C C C C . . . .
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519 G G G G G G G G G G G G . . . .
520 C C C C C C C C C C C C . . . .
521 C C C C C C C C C C C C . . . .
522 A A A A A A A A A A A A . . . .
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530 G G G G G G G G G G G G . . . .
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534 T T T T T T T T T T T T . . . .
535 G G G G G G G G G G G G . . . .
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537 C C C C C C C C C C C C . . . .
538 G G G G G G G G G G G G . . . .
539 T T T T T T T T T T T T . . . .
540 A A A A A A A A A A A A . . . .
541 A G G G G G G G G G G G . . . .
542 A A A A A A A A A A A A . . . .
543 G G G G G G G G G G G G . . . .
544 T T T T T T T T T T T T . . . .
545 A A A A A A A A A A A A . . . .
546 C C C C C C C C C C C C . . . .
547 C C C C C C C C C C C C . . . .
548 G G G G G G G G G G G G . . . .
549 A A A A A A A A A A A A . . . .
550 G G G G G G G G G G G G . . . .
551 A A A A A A A A A A A A . . . .
552 G G G G G G G G G G G G . . . .
553 G G G G G G G G G G G G . . . .
554 C C C C C C C C C C C C . . . .
555 A A A A A A A A A A A A . . . .
556 G G G G G G G G G G G G . . . .
557 T T T T T T T T T T T T . . . .
558 A A A A A A A A A A A A . . . .
559 G G G G G G G G G G G G . . . .
560 G G A A A G G G G G A G . . . .
561 T T T T T T T T T T T T . . . .
562 T T T T T T T T T T T T . . . .
563 G G G G G G G G G G G G . . . .
564 T T T T T T T T T T T T . . . .
565 C C C C C C C C C C C C . . . .
566 G G G G G G G G G G G G . . . .
567 T T T T T T T T T T T T . . . .
568 C C C C C C C C C C C C . . . .
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570 C C C C C C C C C C C C . . . .
571 C C C C C C C C C C C C . . . .
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574 C C C C C C C C C C C C . . . .
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577 C C C C C C C C C C C C . . . .
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579 C C C C C C C C C C C C . . . .
580 C C C C C C C C C C C C . . . .
581 G G G G G G G G G G G G . . . .
582 C C C C C C C C C C C C . . . .
583 G G G G G G G G G G G G . . . .
584 A A A A A A A A A A A A . . . .
585 T T T T T T T T T T T T . . . .
586 T T T T T T T T T T T T . . . .
587 A A A A A A A A A A A A . . . .
588 T T A A A T T T T T A T . . . .
589 G G G G G G G G G G G G . . . .
590 A A A A A A A A A A A A . . . .
591 T T T T T T T T T T T T . . . .
592 G G G G G G G G G G G G . . . .
593 T T T T T T T T T T T T . . . .
594 A A A A A A A A A A A A . . . .
595 C C C C C C C C C C C C . . . .
596 C C C C C C C C C C C C . . . .
597 C C C C C C C C C C C C . . . .
598 G G C C C G G G G G C G . . . .
599 A A A A A A A A A A A A . . . .
600 A A A A A A A A A A A A . . . .
601 T T T T T T T T T T T T . . . .
602 T T T T T T T T T T T T . . . .
603 T T T T T T T T T T T T . . . .
604 C C C C C C C C C C C C . . . .
605 A A A A A A A A A A A A . . . .
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609 C C C C C C C C C C C C . . . .
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617 A A A A A A A A A A A A . . . .
618 G G G G G G G G G G G G . . . .
619 G G G G G G G G G G G G . . . .
620 A A A A A A A A A A A A . . . .
621 G G G G G G G G G G G G . . . .
622 T T T T T T T T T T T T . . . .
623 T T T T T T T T T T T T . . . .
624 G G G G G G G G G G G G . . . .
625 A A A A A A A A A A A A . . . .
626 G G G G G G G G G G G G . . . .
627 T T T T T T T T T T T T . . . .
628 C C C C C C C C C C C C . . . .
629 A A A A A A A A A A A A . . . .
630 G G G G G G G G G G G G . . . .
631 G G G G G G G G G G G G . . . .
632 A A A A A A A A A A A A . . . .
633 G G G G G G G G G G G G . . . .
634 C C G G G C C C C C G C . . . .
635 C G G G G G G G G G G G . . . .
636 C C C C C C C C C C C C . . . .
637 T T G G G T T T T T G T . . . .
638 C C C C C C C C C C C C . . . .
639 C C C C C C C C C C C C . . . .
640 G G G G G G G G G G G G . . . .
641 G G G G G G G G G G G G . . . .
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643 G G G G G G G G G G G G . . . .
644 A A A A A A A A A A A A . . . .
645 A - - - - - - - - - - - . . . .
646 G G G G G G G G G G G G . . . .
647 C C C C C C C C C C C C . . . .
648 G G G G G G G G G G G G . . . .
649 A A A A A A A A A A A A . . . .
650 G G G G G G G G G G G G . . . .
651 G G G G G G G G G G G G . . . .
652 G G G G G G G G G G G G . . . .
653 C C C C C C C C C C C C . . . .
654 T T T T T T T T T T T T . . . .
655 T T T T T T T T T T T T . . . .
656 G G G G G G G G G G G G . . . .
657 G G G G G G G G G G G G . . . .
658 C C C C C C C C C C C C . . . .
659 G G G G G G G G G G G G . . . .
660 T T T T T T T T T T T T . . . .
661 C C C C C C C C C C C C . . . .
662 G G C C C G G G G G C G . . . .
663 T T T T T T T T T T T T . . . .
664 G G G G G G G G G G G G . . . .
665 G G G G G G G G G G G G . . . .
666 A A A A A A A A A A A A . . . .
667 G G G G G G G G G G G G . . . .
668 G G G G G G G G G G G G . . . .
669 A A A A A A A A A A A A . . . .
670 C C C C C C C C C C C C . . . .
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672 T T T T T T T T T T T T . . . .
673 C C C C C C C C C C C C . . . .
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675 . C C C C C C C C C C C . . . .
676 . T T T T T T T T T T T . . . .
677 . G G G G G G G G G G G . . . .
678 . A A A A A A A A A A A A . . .
679 . G G G G G G G G G G G G . . .
680 . C C C C C C C C C C C C . . .
681 . G G G G G G G G G G G G . . .
682 . T T T T T T T T T T T T . . .
683 . C C C C C C C C C C C T . . .
684 . T T T T T T T T T T T T . . .
685 . T T T T T T T T T T T T . . .
686 . C C C C C C C C C C C C . . .
687 . T T T T T T T T T T T T . . .
688 . G G G G G G G G G G G G . . .
689 . C C C C C C C C C C C C . . .
690 . G G G G G G G G G G G G . . .
691 . G G G G G G G G G G G G . . .
692 . T C C C T T T T T C T C . . . 5 transition
693 . T T T T T T T T T T T T . . .
694 . T T T T T T T T T T T T . . .
695 . G G G G G G G G G G G G . . .
696 . C C C C C C C C C C C C . . .
697 . C C C C C C C C C C C C . . .
698 . C C C C C C C C C C C - . . .
699 . T T T T T T T T T T T T . . .
700 . T T T T T T T T T T T T . . .
701 . T T T T T T T T T T T T . . .
702 . C C C C C C C C C C C C . . .
703 . C C C C C C C C C C C C . . .
704 . G G G G G G G G G G G G . . .
705 . G G G G G G G G G G G G . . .
706 . A A A A A A A A A A A A . . .
707 . T T T T T T T T T T T T . . .
708 . A T T T A A A A A T A T . . . 5 transversion
709 . G G G G G G G G G G G G . . .
710 . C C C C C C C C C C C C . . .
711 . G G G G G G G G G G G G . . .
712 . C C C C C C C C C C C C . . .
713 . C C C C C C C C C C C C . . .
714 . G G G G G G G G G G G G . . .
715 . C C C C C C C C C C C C . . .
716 . A A A A A A A A A A A A . . .
717 . G G G G G G G G G G G G . . .
718 . C C C C C C C C C C C C . . .
719 . A A A A A A A A A A A A . . .
720 . A A A A A A A A A A A A . . .
721 . G G G G G G G G G G G G . . .
722 . C C C C C C C C C C C C . . .
723 . G G G G G G G G G G G G . . .
724 . C C C C C C C C C C C C . . .
725 . G G G G G G G G G G G G . . .
726 . C C C C C C C C C C C C . . .
727 . A A A A A A A A A A A A . . .
728 . G G G G G G G G G G G G . . .
729 . A A A A A A A A A A A A . . .
730 . T T T T T T T T T T T T . . .
731 . G G G G G G G G G G G G . . .
732 . T T T T T T T T T T T T . . .
733 . T T T T T T T T T T T T . . .
734 . G G G G G G G G G G G G . . .
735 . A A A A A A A A A A A A . . .
736 . C C C C C C C C C C C C . . .
737 . T T T T T T T T T T T T . . .
738 . G G G G G G G G G G G G . . .
739 . C C C C C C C C C C C C . . .
740 . A A A A A A A A A A A A . . .
741 . G G G G G G G G G G G G . . .
742 . T T T T T T T T T T T T . . .
743 . C C C C C C C C C C C C . . .
744 . A A A A A A A A A A A A . . .
745 . A A A A A A A A A A A A . . .
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1080 . . . . . . . . G G G G G . . .
1081 . . . . . . . . A A A A A . . .
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1083 . . . . . . . . C . C C C . . .
1084 . . . . . . . . T . T T T . . .
1085 . . . . . . . . G . G G G . . .
1086 . . . . . . . . C . C C C . . .
1087 . . . . . . . . . . T T T . . .
1088 . . . . . . . . . . C C C . . .
1089 . . . . . . . . . . C T T . . .
1090 . . . . . . . . . . . G G . . .
1091 . . . . . . . . . . . G G . . .
1092 . . . . . . . . . . . G T . . .
1093 . . . . . . . . . . . . T . . .
1094 . . . . . . . . . . . . T . . .
1095 . . . . . . . . . . . . A . . .
1096 . . . . . . . . . . . . G . . .
1097 . . . . . . . . . . . . A A A .
1098 . . . . . . . . . . . . G G G .
1099 . . . . . . . . . . . . A A A .
1100 . . . . . . . . . . . . T T T .
1101 . . . . . . . . . . . . G G G .
1102 . . . . . . . . . . . . A A A .
1103 . . . . . . . . . . . . A A A .
1104 . . . . . . . . . . . . G G G .
1105 . . . . . . . . . . . . A A A .
1106 . . . . . . . . . . . . A A A .
1107 . . . . . . . . . . . . G G G .
1108 . . . . . . . . . . . . T T T .
1109 . . . . . . . . . . . . T T T .
1110 . . . . . . . . . . . . G G G .
1111 . . . . . . . . . . . . C C C .
1112 . . . . . . . . . . . . G G G .
1113 . . . . . . . . . . . . A A A .
1114 . . . . . . . . . . . . T T T .
1115 . . . . . . . . . . . . T T T .
1116 . . . . . . . . . . . . C C C .
1117 . . . . . . . . . . . . T T T .
1118 . . . . . . . . . . . . A A A .
1119 . . . . . . . . . . . . T T T .
1120 . . . . . . . . . . . . G G G .
1121 . . . . . . . . . . . . A A A .
1122 . . . . . . . . . . . . A A A .
1123 . . . . . . . . . . . . C C C .
1124 . . . . . . . . . . . . T T T .
1125 . . . . . . . . . . . . C C C .
1126 . . . . . . . . . . . . A A A .
1127 . . . . . . . . . . . . A A A .
1128 . . . . . . . . . . . . G G G .
1129 . . . . . . . . . . . . G G G .
1130 . . . . . . . . . . . . A A A .
1131 . . . . . . . . . . . . G G G .
1132 . . . . . . . . . . . . G G G .
1133 . . . . . . . . . . . . A A A .
1134 . . . . . . . . . . . . C C C .
1135 . . . . . . . . . . . . G G G .
1136 . . . . . . . . . . . . T T T .
1137 . . . . . . . . . . . . T T T .
1138 . . . . . . . . . . . . A A A .
1139 . . . . . . . . . . . . G G G .
1140 . . . . . . . . . . . . A A A .
1141 . . . . . . . . . . . . A A A .
1142 . . . . . . . . . . . . A A A .
1143 . . . . . . . . . . . . G G G .
1144 . . . . . . . . . . . . G G G .
1145 . . . . . . . . . . . . C C C .
1146 . . . . . . . . . . . . A A A .
1147 . . . . . . . . . . . . T T T .
1148 . . . . . . . . . . . . T T T .
1149 . . . . . . . . . . . . C C C .
1150 . . . . . . . . . . . . A A A .
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1153 . . . . . . . . . . . . A A A .
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1155 . . . . . . . . . . . . G G G .
1156 . . . . . . . . . . . . G G G .
1157 . . . . . . . . . . . . A A A .
1158 . . . . . . . . . . . . C C C .
1159 . . . . . . . . . . . . A A A .
1160 . . . . . . . . . . . . A A A .
1161 . . . . . . . . . . . . G G G .
1162 . . . . . . . . . . . . G G G .
1163 . . . . . . . . . . . . C C C .
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1167 . . . . . . . . . . . . G G G .
1168 . . . . . . . . . . . . A A A .
1169 . . . . . . . . . . . . G G G .
1170 . . . . . . . . . . . . T T T .
1171 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1174 . . . . . . . . . . . . C C C .
1175 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1177 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1179 . . . . . . . . . . . . A A A .
1180 . . . . . . . . . . . . G G G .
1181 . . . . . . . . . . . . G G G .
1182 . . . . . . . . . . . . T T T .
1183 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1185 . . . . . . . . . . . . A A A .
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1188 . . . . . . . . . . . . G G G .
1189 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1191 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1193 . . . . . . . . . . . . G G G .
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1209 . . . . . . . . . . . . A A A .
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1211 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1219 . . . . . . . . . . . . G G G .
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1225 . . . . . . . . . . . . T T T .
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1227 . . . . . . . . . . . . T T T .
1228 . . . . . . . . . . . . C C C .
1229 . . . . . . . . . . . . A A A .
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1251 . . . . . . . . . . . . C C C .
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1326 . . . . . . . . . . . . T T T T
1327 . . . . . . . . . . . . A A A A
1328 . . . . . . . . . . . . T T T T
1329 . . . . . . . . . . . . C C C C
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1331 . . . . . . . . . . . . G G G G
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1463 . . . . . . . . . . . . A A A A
1464 . . . . . . . . . . . . G G G G
1465 . . . . . . . . . . . . T T T T
1466 . . . . . . . . . . . . C C C C
1467 . . . . . . . . . . . . A A A A
1468 . . . . . . . . . . . . A A A A
1469 . . . . . . . . . . . . T T T T
1470 . . . . . . . . . . . . G G G G
1471 . . . . . . . . . . . . T T T T
1472 . . . . . . . . . . . . T T T T
1473 . . . . . . . . . . . . T T T T
1474 . . . . . . . . . . . . C C C C
1475 . . . . . . . . . . . . A A A A
1476 . . . . . . . . . . . . C C C C
1477 . . . . . . . . . . . . T T T T
1478 . . . . . . . . . . . . C C C C
1479 . . . . . . . . . . . . T T T T
1480 . . . . . . . . . . . . A A A A
1481 . . . . . . . . . . . . C C C C
1482 . . . . . . . . . . . . T T T T
1483 . . . . . . . . . . . . A A A A
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1487 . . . . . . . . . . . . C C C C
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1489 . . . . . . . . . . . . G G G G
1490 . . . . . . . . . . . . C C C C
1491 . . . . . . . . . . . . A A A A
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1493 . . . . . . . . . . . . C C C C
1494 . . . . . . . . . . . . T T T T
1495 . . . . . . . . . . . . G G G G
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1497 . . . . . . . . . . . . A A A A
1498 . . . . . . . . . . . . G G G G
1499 . . . . . . . . . . . . T T T T
1500 . . . . . . . . . . . . C C C C
1501 . . . . . . . . . . . . A A A A
1502 . . . . . . . . . . . . G G G G
1503 . . . . . . . . . . . . T T T T
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1509 . . . . . . . . . . . . G G G G
1510 . . . . . . . . . . . . T T T T
1511 . . . . . . . . . . . . G G G G
1512 . . . . . . . . . . . . . G G G
1513 . . . . . . . . . . . . . C C C
1514 . . . . . . . . . . . . . T T T
1515 . . . . . . . . . . . . . T T T
1516 . . . . . . . . . . . . . T T T
1517 . . . . . . . . . . . . . T T T
1518 . . . . . . . . . . . . . C C C
1519 . . . . . . . . . . . . . T T T
1520 . . . . . . . . . . . . . C C C
1521 . . . . . . . . . . . . . C C C
1522 . . . . . . . . . . . . . T T T
1523 . . . . . . . . . . . . . G G G
1524 . . . . . . . . . . . . . C C C
1525 . . . . . . . . . . . . . G G G
1526 . . . . . . . . . . . . . T T T
1527 . . . . . . . . . . . . . G G G
1528 . . . . . . . . . . . . . A A A
1529 . . . . . . . . . . . . . G G G
1530 . . . . . . . . . . . . . T T T
1531 . . . . . . . . . . . . . T T T
1532 . . . . . . . . . . . . . T T T
1533 . . . . . . . . . . . . . A A A
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1535 . . . . . . . . . . . . . T T T
1536 . . . . . . . . . . . . . G G G
1537 . . . . . . . . . . . . . C C A
1538 . . . . . . . . . . . . . T T T
1539 . . . . . . . . . . . . . A A A
1540 . . . . . . . . . . . . . C C C
1541 . . . . . . . . . . . . . A A A
1542 . . . . . . . . . . . . . A A A
1543 . . . . . . . . . . . . . A A A
1544 . . . . . . . . . . . . . G G G
1545 . . . . . . . . . . . . . A A A
1546 . . . . . . . . . . . . . . A A
1547 . . . . . . . . . . . . . . A .
1548 . . . . . . . . . . . . . . G .
1549 . . . . . . . . . . . . . . T .
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1553 . . . . . . . . . . . . . . A .
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1555 . . . . . . . . . . . . . . A .
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1557 . . . . . . . . . . . . . . C .
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1559 . . . . . . . . . . . . . . T .